Фітоспектр використовується як на відкритих площах, так і в теплицях. Перед посівом насіння рекомендовано вимочування в робочому розчині Фітоспектру протягом 3-10 годин. Витрата розчину – 1 л на 1 кг насіння. Розчин використовують замість води для стандартного вимочування насіння овочів перед посівом. Обробка насіння стимулює рост розсади на ранніх стадіях розвитку та імунізує проти певних захворювань.
Крім того, найбільш ефективним способом застосування Фітоспектру є його інтеграція в існуючі технології оброблення овочевих рослин. Для цього рекомендована концентрація робочого розчину (1 мл на 10 л) використовується для зрошення, кореневого та листкового підживлення, краплевого зрошення, наповнення торф’яних сумішей ґрунту.
Фітоспектр можна додавати в розчини інсектицидів, гербіцидів, нематоцидів і добрив, що застосовуються для стандартних обробок. Завдяки імунізуючій дії Фітоспектру використання фунгіцидів може бути зменшено до 50%. Завдяки стимулюючій і антистресовій дії Фітоспектру значно підвищується ефективність використання агрохімікатів і поживних речовин, що в першу чергу впливає на збільшення врожайності.
Таким чином Фітоспектр діє як добриво, фунгіцид, нематоцид і стимулятор росту рослин; часто він не вимагає використання інших речовин з перерахованих груп.